Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACGP22612 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms