Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1B2P21281 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1B2P21281 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1B2P21281 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms