Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2B1P20020 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms