Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT15P19012 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT15P19012 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT15P19012 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT15P19012 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT15P19012 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT15P19012 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT15P19012 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT15P19012 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT15P19012 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT15P19012 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT15P19012 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT15P19012 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT15P19012 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT15P19012 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT15P19012 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT15P19012 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT15P19012 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT15P19012 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT15P19012 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT15P19012 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT15P19012 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT15P19012 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT15P19012 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT15P19012 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT15P19012 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT15P19012 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT15P19012 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT15P19012 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT15P19012 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT15P19012 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT15P19012 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT15P19012 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT15P19012 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT15P19012 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT15P19012 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT15P19012 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT15P19012 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT15P19012 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT15P19012 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT15P19012 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT15P19012 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT15P19012 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT15P19012 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT15P19012 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT15P19012 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT15P19012 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT15P19012 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT15P19012 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT15P19012 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT15P19012 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT15P19012 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT15P19012 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT15P19012 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT15P19012 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT15P19012 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT15P19012 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT15P19012 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT15P19012 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT15P19012 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT15P19012 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT15P19012 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT15P19012 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT15P19012 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT15P19012 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT15P19012 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT15P19012 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT15P19012 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT15P19012 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT15P19012 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT15P19012 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT15P19012 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT15P19012 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT15P19012 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT15P19012 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms