Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHCEP18577 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHCEP18577 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHCEP18577 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHCEP18577 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHCEP18577 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHCEP18577 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHCEP18577 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHCEP18577 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHCEP18577 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHCEP18577 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHCEP18577 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHCEP18577 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHCEP18577 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHCEP18577 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHCEP18577 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHCEP18577 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHCEP18577 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHCEP18577 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHCEP18577 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHCEP18577 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHCEP18577 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHCEP18577 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHCEP18577 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHCEP18577 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHCEP18577 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHCEP18577 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHCEP18577 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHCEP18577 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHCEP18577 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHCEP18577 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHCEP18577 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHCEP18577 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHCEP18577 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHCEP18577 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHCEP18577 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHCEP18577 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHCEP18577 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHCEP18577 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHCEP18577 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHCEP18577 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHCEP18577 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHCEP18577 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHCEP18577 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHCEP18577 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHCEP18577 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHCEP18577 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHCEP18577 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHCEP18577 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHCEP18577 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHCEP18577 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHCEP18577 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHCEP18577 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHCEP18577 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHCEP18577 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHCEP18577 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHCEP18577 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHCEP18577 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHCEP18577 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHCEP18577 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHCEP18577 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHCEP18577 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHCEP18577 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHCEP18577 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHCEP18577 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHCEP18577 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHCEP18577 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHCEP18577 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHCEP18577 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHCEP18577 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHCEP18577 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHCEP18577 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHCEP18577 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHCEP18577 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHCEP18577 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHCEP18577 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms