Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB6P17509 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB6P17509 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms