Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKCAP17252 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms