Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAG1P15918 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAG1P15918 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAG1P15918 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAG1P15918 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAG1P15918 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAG1P15918 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAG1P15918 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RAG1P15918 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAG1P15918 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAG1P15918 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAG1P15918 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAG1P15918 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAG1P15918 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAG1P15918 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAG1P15918 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAG1P15918 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAG1P15918 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAG1P15918 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAG1P15918 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAG1P15918 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAG1P15918 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAG1P15918 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAG1P15918 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAG1P15918 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAG1P15918 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAG1P15918 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAG1P15918 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAG1P15918 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAG1P15918 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAG1P15918 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAG1P15918 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAG1P15918 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAG1P15918 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAG1P15918 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAG1P15918 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAG1P15918 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAG1P15918 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAG1P15918 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RAG1P15918 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAG1P15918 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAG1P15918 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAG1P15918 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAG1P15918 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAG1P15918 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAG1P15918 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAG1P15918 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAG1P15918 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAG1P15918 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAG1P15918 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAG1P15918 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAG1P15918 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAG1P15918 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAG1P15918 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAG1P15918 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAG1P15918 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAG1P15918 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAG1P15918 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAG1P15918 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAG1P15918 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAG1P15918 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAG1P15918 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAG1P15918 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAG1P15918 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAG1P15918 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAG1P15918 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAG1P15918 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAG1P15918 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAG1P15918 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAG1P15918 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAG1P15918 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAG1P15918 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAG1P15918 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAG1P15918 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAG1P15918 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAG1P15918 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAG1P15918 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAG1P15918 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAG1P15918 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAG1P15918 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAG1P15918 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAG1P15918 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAG1P15918 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAG1P15918 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAG1P15918 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAG1P15918 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAG1P15918 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAG1P15918 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAG1P15918 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAG1P15918 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RAG1P15918 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAG1P15918 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAG1P15918 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAG1P15918 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAG1P15918 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAG1P15918 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAG1P15918 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAG1P15918 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAG1P15918 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAG1P15918 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms