Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF2RAP15509 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF2RAP15509 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms