Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms