Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA4P13612 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms