Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD8P13378 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD8P13378 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms