Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK4P11802 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK4P11802 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK4P11802 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK4P11802 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK4P11802 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK4P11802 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK4P11802 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK4P11802 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK4P11802 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK4P11802 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK4P11802 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK4P11802 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK4P11802 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK4P11802 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK4P11802 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK4P11802 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK4P11802 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK4P11802 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK4P11802 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK4P11802 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK4P11802 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK4P11802 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK4P11802 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK4P11802 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK4P11802 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK4P11802 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK4P11802 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK4P11802 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK4P11802 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK4P11802 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK4P11802 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK4P11802 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK4P11802 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK4P11802 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK4P11802 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK4P11802 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK4P11802 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK4P11802 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK4P11802 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK4P11802 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK4P11802 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK4P11802 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK4P11802 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK4P11802 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK4P11802 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK4P11802 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK4P11802 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK4P11802 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK4P11802 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK4P11802 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK4P11802 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK4P11802 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK4P11802 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK4P11802 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK4P11802 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK4P11802 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK4P11802 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK4P11802 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK4P11802 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK4P11802 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK4P11802 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK4P11802 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK4P11802 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK4P11802 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK4P11802 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK4P11802 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK4P11802 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK4P11802 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK4P11802 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK4P11802 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK4P11802 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK4P11802 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK4P11802 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK4P11802 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK4P11802 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK4P11802 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK4P11802 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK4P11802 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK4P11802 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK4P11802 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK4P11802 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK4P11802 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK4P11802 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK4P11802 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK4P11802 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK4P11802 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK4P11802 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK4P11802 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK4P11802 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK4P11802 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK4P11802 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK4P11802 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK4P11802 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms