Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP1P11387 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP1P11387 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP1P11387 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP1P11387 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP1P11387 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP1P11387 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP1P11387 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP1P11387 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1P11387 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1P11387 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1P11387 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1P11387 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1P11387 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP1P11387 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP1P11387 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP1P11387 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP1P11387 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP1P11387 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP1P11387 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP1P11387 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP1P11387 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOP1P11387 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOP1P11387 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP1P11387 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP1P11387 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP1P11387 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP1P11387 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP1P11387 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP1P11387 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP1P11387 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOP1P11387 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOP1P11387 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOP1P11387 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOP1P11387 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOP1P11387 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOP1P11387 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOP1P11387 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1P11387 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1P11387 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1P11387 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1P11387 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1P11387 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1P11387 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1P11387 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1P11387 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1P11387 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1P11387 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1P11387 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1P11387 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1P11387 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1P11387 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1P11387 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1P11387 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1P11387 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP1P11387 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP1P11387 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP1P11387 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP1P11387 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP1P11387 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP1P11387 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP1P11387 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP1P11387 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP1P11387 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP1P11387 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP1P11387 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP1P11387 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP1P11387 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP1P11387 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP1P11387 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP1P11387 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP1P11387 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP1P11387 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1P11387 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1P11387 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1P11387 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1P11387 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1P11387 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP1P11387 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP1P11387 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP1P11387 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP1P11387 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP1P11387 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP1P11387 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOP1P11387 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOP1P11387 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOP1P11387 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOP1P11387 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TOP1P11387 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOP1P11387 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOP1P11387 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOP1P11387 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOP1P11387 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOP1P11387 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOP1P11387 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOP1P11387 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOP1P11387 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOP1P11387 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1P11387 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1P11387 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms