Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LAMC1P11047 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC1P11047 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms