Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD8BP10966 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD8BP10966 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD8BP10966 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD8BP10966 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD8BP10966 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD8BP10966 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD8BP10966 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD8BP10966 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD8BP10966 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD8BP10966 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD8BP10966 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD8BP10966 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD8BP10966 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8BP10966 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8BP10966 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8BP10966 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD8BP10966 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8BP10966 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8BP10966 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8BP10966 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD8BP10966 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD8BP10966 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8BP10966 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD8BP10966 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD8BP10966 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD8BP10966 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD8BP10966 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD8BP10966 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD8BP10966 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD8BP10966 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD8BP10966 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD8BP10966 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD8BP10966 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD8BP10966 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD8BP10966 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8BP10966 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8BP10966 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8BP10966 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8BP10966 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8BP10966 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8BP10966 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8BP10966 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8BP10966 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8BP10966 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8BP10966 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8BP10966 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8BP10966 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8BP10966 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8BP10966 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD8BP10966 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD8BP10966 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD8BP10966 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CD8BP10966 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD8BP10966 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD8BP10966 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8BP10966 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8BP10966 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8BP10966 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8BP10966 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8BP10966 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8BP10966 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8BP10966 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8BP10966 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8BP10966 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8BP10966 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8BP10966 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8BP10966 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8BP10966 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8BP10966 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8BP10966 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8BP10966 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD8BP10966 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD8BP10966 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD8BP10966 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD8BP10966 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD8BP10966 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CD8BP10966 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD8BP10966 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8BP10966 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8BP10966 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8BP10966 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8BP10966 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8BP10966 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8BP10966 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8BP10966 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8BP10966 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8BP10966 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8BP10966 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms