Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD28P10747 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD28P10747 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD28P10747 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD28P10747 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD28P10747 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD28P10747 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD28P10747 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD28P10747 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD28P10747 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD28P10747 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD28P10747 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD28P10747 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD28P10747 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD28P10747 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD28P10747 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD28P10747 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD28P10747 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD28P10747 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD28P10747 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD28P10747 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD28P10747 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD28P10747 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD28P10747 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD28P10747 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD28P10747 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD28P10747 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD28P10747 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD28P10747 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD28P10747 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD28P10747 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD28P10747 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CD28P10747 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD28P10747 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD28P10747 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD28P10747 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD28P10747 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD28P10747 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD28P10747 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD28P10747 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD28P10747 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD28P10747 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD28P10747 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD28P10747 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD28P10747 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD28P10747 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD28P10747 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD28P10747 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD28P10747 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD28P10747 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD28P10747 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD28P10747 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD28P10747 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD28P10747 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD28P10747 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD28P10747 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD28P10747 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD28P10747 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD28P10747 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD28P10747 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD28P10747 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD28P10747 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD28P10747 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms