Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HKR1P10072 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HKR1P10072 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HKR1P10072 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HKR1P10072 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HKR1P10072 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HKR1P10072 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HKR1P10072 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HKR1P10072 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HKR1P10072 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HKR1P10072 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HKR1P10072 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HKR1P10072 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HKR1P10072 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HKR1P10072 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HKR1P10072 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HKR1P10072 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HKR1P10072 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HKR1P10072 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HKR1P10072 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HKR1P10072 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HKR1P10072 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HKR1P10072 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HKR1P10072 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HKR1P10072 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HKR1P10072 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HKR1P10072 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HKR1P10072 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HKR1P10072 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HKR1P10072 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HKR1P10072 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HKR1P10072 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HKR1P10072 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HKR1P10072 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HKR1P10072 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HKR1P10072 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HKR1P10072 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HKR1P10072 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HKR1P10072 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HKR1P10072 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HKR1P10072 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HKR1P10072 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HKR1P10072 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HKR1P10072 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HKR1P10072 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HKR1P10072 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HKR1P10072 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HKR1P10072 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HKR1P10072 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HKR1P10072 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HKR1P10072 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HKR1P10072 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HKR1P10072 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HKR1P10072 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HKR1P10072 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HKR1P10072 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HKR1P10072 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HKR1P10072 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HKR1P10072 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HKR1P10072 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HKR1P10072 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HKR1P10072 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HKR1P10072 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HKR1P10072 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HKR1P10072 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HKR1P10072 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HKR1P10072 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HKR1P10072 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HKR1P10072 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HKR1P10072 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HKR1P10072 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HKR1P10072 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HKR1P10072 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HKR1P10072 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HKR1P10072 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HKR1P10072 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HKR1P10072 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HKR1P10072 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HKR1P10072 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HKR1P10072 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HKR1P10072 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HKR1P10072 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HKR1P10072 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HKR1P10072 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HKR1P10072 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HKR1P10072 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms