Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA3

SNHG28, Putative uncharacterized protein SNHG28, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28P0DPA3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNHG28P0DPA3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNHG28P0DPA3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms