Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms