Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SRGAP2BP0DMP2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms