Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM200BP0CF97 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms