Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM228BP0C875 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms