Protein–RNA interactions for Protein: P0C264

SBK3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK3P0C264 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBK3P0C264 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK3P0C264 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms