Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP10P09238 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP10P09238 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP10P09238 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP10P09238 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP10P09238 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MMP10P09238 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MMP10P09238 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MMP10P09238 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MMP10P09238 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MMP10P09238 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MMP10P09238 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MMP10P09238 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
MMP10P09238 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MMP10P09238 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MMP10P09238 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MMP10P09238 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MMP10P09238 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MMP10P09238 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MMP10P09238 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MMP10P09238 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MMP10P09238 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MMP10P09238 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MMP10P09238 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MMP10P09238 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MMP10P09238 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MMP10P09238 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MMP10P09238 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MMP10P09238 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP10P09238 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP10P09238 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MMP10P09238 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MMP10P09238 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MMP10P09238 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MMP10P09238 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MMP10P09238 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MMP10P09238 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MMP10P09238 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MMP10P09238 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MMP10P09238 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MMP10P09238 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MMP10P09238 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MMP10P09238 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MMP10P09238 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MMP10P09238 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MMP10P09238 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MMP10P09238 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MMP10P09238 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MMP10P09238 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MMP10P09238 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MMP10P09238 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MMP10P09238 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MMP10P09238 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MMP10P09238 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MMP10P09238 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MMP10P09238 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMP10P09238 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMP10P09238 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MMP10P09238 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MMP10P09238 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MMP10P09238 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MMP10P09238 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MMP10P09238 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MMP10P09238 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MMP10P09238 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MMP10P09238 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MMP10P09238 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MMP10P09238 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MMP10P09238 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MMP10P09238 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MMP10P09238 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MMP10P09238 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MMP10P09238 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MMP10P09238 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MMP10P09238 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MMP10P09238 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MMP10P09238 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MMP10P09238 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MMP10P09238 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MMP10P09238 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MMP10P09238 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MMP10P09238 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MMP10P09238 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MMP10P09238 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MMP10P09238 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MMP10P09238 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MMP10P09238 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MMP10P09238 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MMP10P09238 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MMP10P09238 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MMP10P09238 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MMP10P09238 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MMP10P09238 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MMP10P09238 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MMP10P09238 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MMP10P09238 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MMP10P09238 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MMP10P09238 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MMP10P09238 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MMP10P09238 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms