Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYPP08247 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYPP08247 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYPP08247 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYPP08247 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYPP08247 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYPP08247 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYPP08247 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYPP08247 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYPP08247 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYPP08247 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYPP08247 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYPP08247 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYPP08247 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYPP08247 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPP08247 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPP08247 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPP08247 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPP08247 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPP08247 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPP08247 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPP08247 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPP08247 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPP08247 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPP08247 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPP08247 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPP08247 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPP08247 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPP08247 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPP08247 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPP08247 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPP08247 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPP08247 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPP08247 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPP08247 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPP08247 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPP08247 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYPP08247 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYPP08247 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYPP08247 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYPP08247 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYPP08247 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYPP08247 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYPP08247 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYPP08247 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYPP08247 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYPP08247 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYPP08247 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYPP08247 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYPP08247 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYPP08247 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPP08247 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPP08247 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPP08247 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPP08247 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPP08247 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPP08247 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPP08247 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPP08247 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPP08247 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPP08247 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPP08247 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPP08247 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPP08247 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPP08247 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPP08247 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPP08247 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPP08247 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPP08247 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPP08247 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPP08247 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPP08247 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPP08247 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPP08247 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPP08247 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPP08247 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPP08247 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPP08247 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPP08247 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPP08247 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPP08247 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPP08247 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPP08247 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPP08247 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPP08247 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPP08247 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPP08247 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPP08247 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.4 ms