Protein–RNA interactions for Protein: P02675

FGB, Fibrinogen beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGBP02675 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGBP02675 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGBP02675 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGBP02675 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGBP02675 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGBP02675 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGBP02675 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGBP02675 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGBP02675 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FGBP02675 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGBP02675 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGBP02675 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGBP02675 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGBP02675 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGBP02675 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGBP02675 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGBP02675 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGBP02675 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGBP02675 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGBP02675 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGBP02675 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FGBP02675 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGBP02675 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGBP02675 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGBP02675 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGBP02675 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGBP02675 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGBP02675 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGBP02675 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGBP02675 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGBP02675 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGBP02675 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGBP02675 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGBP02675 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGBP02675 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGBP02675 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGBP02675 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGBP02675 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGBP02675 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGBP02675 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGBP02675 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGBP02675 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGBP02675 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FGBP02675 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGBP02675 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGBP02675 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGBP02675 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGBP02675 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGBP02675 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGBP02675 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGBP02675 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FGBP02675 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGBP02675 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGBP02675 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGBP02675 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FGBP02675 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGBP02675 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGBP02675 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGBP02675 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGBP02675 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGBP02675 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGBP02675 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGBP02675 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGBP02675 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FGBP02675 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGBP02675 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGBP02675 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FGBP02675 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGBP02675 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGBP02675 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGBP02675 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGBP02675 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGBP02675 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGBP02675 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FGBP02675 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FGBP02675 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGBP02675 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGBP02675 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGBP02675 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGBP02675 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGBP02675 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGBP02675 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGBP02675 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGBP02675 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGBP02675 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGBP02675 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGBP02675 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGBP02675 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGBP02675 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGBP02675 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGBP02675 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGBP02675 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGBP02675 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGBP02675 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGBP02675 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGBP02675 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGBP02675 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FGBP02675 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGBP02675 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGBP02675 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms