Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A1P02462 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL4A1P02462 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A1P02462 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms