Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV12-3P01733 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms