Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGKV3-15P01624 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGKV3-15P01624 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGKV3-15P01624 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGKV3-15P01624 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IGKV3-15P01624 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGKV3-15P01624 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGKV3-15P01624 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGKV3-15P01624 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IGKV3-15P01624 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGKV3-15P01624 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
IGKV3-15P01624 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV3-15P01624 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms