Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP4O95707 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP4O95707 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP4O95707 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP4O95707 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP4O95707 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP4O95707 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP4O95707 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP4O95707 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP4O95707 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP4O95707 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP4O95707 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP4O95707 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP4O95707 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP4O95707 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP4O95707 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP4O95707 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP4O95707 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP4O95707 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP4O95707 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP4O95707 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP4O95707 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP4O95707 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP4O95707 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP4O95707 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP4O95707 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP4O95707 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP4O95707 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP4O95707 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP4O95707 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP4O95707 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP4O95707 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP4O95707 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP4O95707 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP4O95707 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP4O95707 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP4O95707 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP4O95707 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP4O95707 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP4O95707 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP4O95707 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP4O95707 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POP4O95707 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP4O95707 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP4O95707 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP4O95707 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP4O95707 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP4O95707 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP4O95707 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP4O95707 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP4O95707 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP4O95707 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP4O95707 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP4O95707 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP4O95707 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP4O95707 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP4O95707 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP4O95707 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP4O95707 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP4O95707 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP4O95707 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP4O95707 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP4O95707 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP4O95707 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP4O95707 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP4O95707 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP4O95707 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP4O95707 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP4O95707 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP4O95707 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP4O95707 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP4O95707 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP4O95707 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP4O95707 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP4O95707 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP4O95707 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP4O95707 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP4O95707 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP4O95707 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POP4O95707 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP4O95707 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP4O95707 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP4O95707 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP4O95707 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP4O95707 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP4O95707 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP4O95707 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP4O95707 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP4O95707 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP4O95707 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP4O95707 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP4O95707 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP4O95707 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POP4O95707 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP4O95707 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP4O95707 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP4O95707 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP4O95707 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP4O95707 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP4O95707 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms