Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF12O95522 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF12O95522 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms