Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRATO95237 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRATO95237 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRATO95237 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRATO95237 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRATO95237 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRATO95237 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRATO95237 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRATO95237 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRATO95237 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRATO95237 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRATO95237 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRATO95237 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRATO95237 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRATO95237 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRATO95237 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRATO95237 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRATO95237 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRATO95237 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRATO95237 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRATO95237 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRATO95237 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRATO95237 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRATO95237 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRATO95237 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRATO95237 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRATO95237 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRATO95237 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRATO95237 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRATO95237 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRATO95237 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRATO95237 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRATO95237 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRATO95237 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRATO95237 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRATO95237 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRATO95237 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRATO95237 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRATO95237 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRATO95237 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRATO95237 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRATO95237 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRATO95237 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRATO95237 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRATO95237 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRATO95237 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRATO95237 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRATO95237 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRATO95237 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRATO95237 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRATO95237 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRATO95237 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRATO95237 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRATO95237 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRATO95237 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRATO95237 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRATO95237 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRATO95237 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRATO95237 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRATO95237 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRATO95237 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRATO95237 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRATO95237 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRATO95237 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRATO95237 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRATO95237 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRATO95237 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRATO95237 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRATO95237 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRATO95237 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRATO95237 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRATO95237 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRATO95237 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRATO95237 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRATO95237 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRATO95237 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRATO95237 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRATO95237 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRATO95237 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRATO95237 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRATO95237 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRATO95237 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRATO95237 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRATO95237 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRATO95237 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRATO95237 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRATO95237 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRATO95237 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRATO95237 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRATO95237 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRATO95237 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRATO95237 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRATO95237 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRATO95237 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRATO95237 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRATO95237 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRATO95237 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRATO95237 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRATO95237 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRATO95237 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms