Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CLSTN1O94985 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN1O94985 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms