Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG12O94817 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG12O94817 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG12O94817 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG12O94817 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG12O94817 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG12O94817 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG12O94817 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG12O94817 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG12O94817 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG12O94817 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG12O94817 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG12O94817 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG12O94817 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG12O94817 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG12O94817 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG12O94817 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG12O94817 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG12O94817 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG12O94817 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG12O94817 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG12O94817 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG12O94817 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG12O94817 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG12O94817 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG12O94817 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG12O94817 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG12O94817 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG12O94817 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG12O94817 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG12O94817 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG12O94817 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG12O94817 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG12O94817 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG12O94817 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG12O94817 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG12O94817 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG12O94817 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms