Protein–RNA interactions for Protein: O76013

KRT36, Keratin, type I cuticular Ha6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT36O76013 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT36O76013 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT36O76013 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT36O76013 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT36O76013 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT36O76013 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT36O76013 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT36O76013 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT36O76013 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT36O76013 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT36O76013 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT36O76013 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT36O76013 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT36O76013 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT36O76013 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT36O76013 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT36O76013 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT36O76013 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT36O76013 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT36O76013 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT36O76013 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT36O76013 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT36O76013 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT36O76013 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT36O76013 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT36O76013 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT36O76013 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT36O76013 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT36O76013 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT36O76013 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT36O76013 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT36O76013 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT36O76013 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT36O76013 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT36O76013 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT36O76013 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT36O76013 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT36O76013 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT36O76013 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT36O76013 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT36O76013 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT36O76013 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT36O76013 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT36O76013 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT36O76013 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT36O76013 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT36O76013 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT36O76013 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT36O76013 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT36O76013 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT36O76013 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT36O76013 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT36O76013 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT36O76013 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT36O76013 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT36O76013 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT36O76013 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT36O76013 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT36O76013 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT36O76013 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT36O76013 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT36O76013 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT36O76013 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT36O76013 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT36O76013 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT36O76013 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT36O76013 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT36O76013 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT36O76013 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT36O76013 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT36O76013 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT36O76013 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT36O76013 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT36O76013 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT36O76013 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT36O76013 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT36O76013 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT36O76013 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT36O76013 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT36O76013 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT36O76013 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT36O76013 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT36O76013 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT36O76013 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms