Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CAPN15O75808 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN15O75808 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms