Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP2O75563 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms