Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN11O75508 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN11O75508 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms