Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC4O75487 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC4O75487 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC4O75487 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC4O75487 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC4O75487 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC4O75487 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC4O75487 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC4O75487 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC4O75487 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC4O75487 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC4O75487 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC4O75487 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC4O75487 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC4O75487 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC4O75487 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC4O75487 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC4O75487 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC4O75487 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC4O75487 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC4O75487 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC4O75487 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC4O75487 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC4O75487 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC4O75487 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC4O75487 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC4O75487 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC4O75487 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC4O75487 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC4O75487 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC4O75487 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC4O75487 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC4O75487 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC4O75487 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC4O75487 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC4O75487 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC4O75487 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC4O75487 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC4O75487 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC4O75487 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC4O75487 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms