Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH16O75309 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH16O75309 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH16O75309 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH16O75309 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH16O75309 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH16O75309 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH16O75309 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH16O75309 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH16O75309 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH16O75309 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH16O75309 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH16O75309 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH16O75309 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH16O75309 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH16O75309 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH16O75309 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH16O75309 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH16O75309 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH16O75309 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH16O75309 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH16O75309 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH16O75309 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH16O75309 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH16O75309 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH16O75309 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH16O75309 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH16O75309 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH16O75309 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH16O75309 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH16O75309 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH16O75309 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH16O75309 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH16O75309 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH16O75309 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH16O75309 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH16O75309 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH16O75309 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH16O75309 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH16O75309 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH16O75309 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH16O75309 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH16O75309 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH16O75309 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH16O75309 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH16O75309 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH16O75309 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH16O75309 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH16O75309 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH16O75309 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH16O75309 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH16O75309 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH16O75309 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH16O75309 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH16O75309 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH16O75309 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH16O75309 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH16O75309 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH16O75309 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH16O75309 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH16O75309 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH16O75309 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH16O75309 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH16O75309 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH16O75309 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH16O75309 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH16O75309 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH16O75309 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH16O75309 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH16O75309 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH16O75309 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH16O75309 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH16O75309 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH16O75309 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH16O75309 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH16O75309 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH16O75309 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH16O75309 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH16O75309 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH16O75309 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH16O75309 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH16O75309 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH16O75309 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH16O75309 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH16O75309 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH16O75309 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH16O75309 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH16O75309 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH16O75309 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH16O75309 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH16O75309 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH16O75309 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH16O75309 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH16O75309 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH16O75309 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH16O75309 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH16O75309 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH16O75309 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH16O75309 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH16O75309 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms