Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX2O60749 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX2O60749 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX2O60749 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX2O60749 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX2O60749 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX2O60749 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX2O60749 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX2O60749 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX2O60749 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX2O60749 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX2O60749 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX2O60749 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX2O60749 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX2O60749 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX2O60749 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX2O60749 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX2O60749 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX2O60749 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX2O60749 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX2O60749 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX2O60749 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX2O60749 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX2O60749 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX2O60749 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX2O60749 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX2O60749 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX2O60749 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX2O60749 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX2O60749 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX2O60749 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX2O60749 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX2O60749 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX2O60749 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX2O60749 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX2O60749 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX2O60749 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX2O60749 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX2O60749 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX2O60749 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX2O60749 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX2O60749 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX2O60749 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX2O60749 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX2O60749 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX2O60749 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX2O60749 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX2O60749 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX2O60749 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX2O60749 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX2O60749 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX2O60749 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX2O60749 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX2O60749 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX2O60749 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX2O60749 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX2O60749 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX2O60749 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX2O60749 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX2O60749 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX2O60749 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX2O60749 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX2O60749 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX2O60749 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX2O60749 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX2O60749 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX2O60749 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX2O60749 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX2O60749 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX2O60749 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX2O60749 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX2O60749 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX2O60749 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX2O60749 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX2O60749 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX2O60749 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX2O60749 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX2O60749 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX2O60749 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX2O60749 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX2O60749 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX2O60749 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX2O60749 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX2O60749 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX2O60749 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX2O60749 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX2O60749 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX2O60749 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms