Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRICKLE3O43900 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE3O43900 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE3O43900 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms