Protein–RNA interactions for Protein: O43511

SLC26A4, Pendrin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A4O43511 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC26A4O43511 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC26A4O43511 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms