Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID2O43424 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID2O43424 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID2O43424 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID2O43424 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID2O43424 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID2O43424 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID2O43424 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID2O43424 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID2O43424 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID2O43424 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID2O43424 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID2O43424 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID2O43424 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID2O43424 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID2O43424 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID2O43424 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID2O43424 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID2O43424 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID2O43424 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID2O43424 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID2O43424 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID2O43424 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID2O43424 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID2O43424 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID2O43424 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID2O43424 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID2O43424 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID2O43424 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID2O43424 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID2O43424 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID2O43424 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID2O43424 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID2O43424 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID2O43424 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID2O43424 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID2O43424 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID2O43424 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID2O43424 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID2O43424 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID2O43424 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID2O43424 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID2O43424 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID2O43424 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID2O43424 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRID2O43424 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRID2O43424 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID2O43424 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID2O43424 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID2O43424 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID2O43424 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID2O43424 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID2O43424 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID2O43424 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID2O43424 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID2O43424 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID2O43424 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID2O43424 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID2O43424 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID2O43424 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID2O43424 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID2O43424 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID2O43424 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID2O43424 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID2O43424 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID2O43424 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID2O43424 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID2O43424 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID2O43424 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID2O43424 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID2O43424 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID2O43424 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID2O43424 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID2O43424 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID2O43424 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID2O43424 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID2O43424 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID2O43424 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID2O43424 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID2O43424 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID2O43424 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID2O43424 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID2O43424 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID2O43424 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID2O43424 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID2O43424 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID2O43424 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID2O43424 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID2O43424 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID2O43424 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID2O43424 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID2O43424 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID2O43424 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID2O43424 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GRID2O43424 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID2O43424 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID2O43424 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID2O43424 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID2O43424 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID2O43424 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms