Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA2O43364 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms