Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT1O43278 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPINT1O43278 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPINT1O43278 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT1O43278 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT1O43278 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT1O43278 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT1O43278 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT1O43278 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT1O43278 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT1O43278 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT1O43278 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT1O43278 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT1O43278 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT1O43278 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms