Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNPHO15079 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNPHO15079 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNPHO15079 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNPHO15079 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNPHO15079 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNPHO15079 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNPHO15079 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNPHO15079 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNPHO15079 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNPHO15079 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNPHO15079 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNPHO15079 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNPHO15079 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNPHO15079 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNPHO15079 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNPHO15079 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNPHO15079 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNPHO15079 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNPHO15079 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNPHO15079 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNPHO15079 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNPHO15079 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNPHO15079 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNPHO15079 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNPHO15079 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNPHO15079 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNPHO15079 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNPHO15079 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNPHO15079 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNPHO15079 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNPHO15079 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNPHO15079 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNPHO15079 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNPHO15079 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNPHO15079 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNPHO15079 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNPHO15079 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNPHO15079 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNPHO15079 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNPHO15079 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNPHO15079 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNPHO15079 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNPHO15079 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNPHO15079 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNPHO15079 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNPHO15079 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNPHO15079 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNPHO15079 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNPHO15079 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms