Protein–RNA interactions for Protein: O14730

RIOK3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK3O14730 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK3O14730 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK3O14730 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms