Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGRNO00468 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGRNO00468 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGRNO00468 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGRNO00468 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGRNO00468 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGRNO00468 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AGRNO00468 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGRNO00468 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGRNO00468 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGRNO00468 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGRNO00468 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AGRNO00468 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGRNO00468 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGRNO00468 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGRNO00468 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGRNO00468 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGRNO00468 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGRNO00468 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGRNO00468 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGRNO00468 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AGRNO00468 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AGRNO00468 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AGRNO00468 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AGRNO00468 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGRNO00468 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGRNO00468 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGRNO00468 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGRNO00468 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGRNO00468 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGRNO00468 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGRNO00468 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGRNO00468 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGRNO00468 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGRNO00468 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGRNO00468 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGRNO00468 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGRNO00468 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGRNO00468 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGRNO00468 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGRNO00468 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGRNO00468 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGRNO00468 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGRNO00468 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGRNO00468 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGRNO00468 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGRNO00468 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms